為了降低制藥廢水對自然環境的負面影響，制藥企業和相關學者不斷加強制藥廢水處理技術的研究，針對傳統制藥廢水處理技術的不足，大力研發新型處理技術，如生物膜技術、超聲波技術、微波技術等。總之，只有針對性地采用廢水處理技術（或技術組合），才能確保制藥廢水達到行業排放標準。

1、超聲波處理法

使用20000Hz以上頻率的超聲波輻射溶液，可以產生一定的化學反應，產生超聲空化效應。該項技術的核心就是利用超聲波的·OH自由基氧化、氣泡內燃燒分解、超臨界水體氧化形式實現廢水凈化目標。近些年，超聲波技術更加成熟，將該項技術應用在制藥廢水處理領域并結合生物接觸氧化法，對高濃度廢水的凈化效果非常顯著。

2、微波處理法

該方法主要利用特定波長的電磁波進行廢水處理，但是試驗證明，單獨采用某個波長微波進行廢水處理效果并不理想，所以微波處理技術要和其他處理技術結合使用，從而達到良好的處理效果。例如，將微波處理技術和活性炭處理方案結合，活性炭表面吸附難以處理的吸附物后，可以采用微波技術對活性炭表面的吸附物進行解吸，統一處理表面吸附物，這樣可以恢復活性炭的吸附功能，實現活性炭的循環使用，進而大大降低活性炭吸附技術的使用成本。

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